Nextflow 应用管理
最后更新时间：2024-10-22 16:05:05
创建应用
1. 进入任意工作项目，点击页面右上角新增，显示新增应用弹窗，选择应用类型 NEXTFLOW。
2. 支持通过引用 Git 地址的方式新建 Nextflow 应用，填写必要的应用信息，如应用名称、待引用 Git 地址等（私有仓库还需要填写 Git 用户名和密码或 Token），待验证通过后，点击下一步。
3. 选择 Tag 或 Branch 并确认后即可创建 Nextflow 应用。
运行应用
1. 平台支持运行 Nextflow 应用，点击应用卡片上的运行，进入运行流程。
2. 进入运行设置页，设置运行任务参数，填写任务名称、描述、config、profile 等必要信息。从项目已绑定的环境列表中选择该任务的运行环境，并设置该任务的缓存保留期限，运行结果提醒渠道，是否需要输出报告等选项。
说明：
1. 选择开启 report 选项，任务执行完毕后，可在运行批次详情页指标中查看报告内容。
2. 运行任务时将使用默认缓存卷作为缓存，其挂载路径暂不支持修改。启动路径支持自定义，命令
nextflow run 将在此路径执行。
3. 运行参数设置模块，支持多种方式设置运行参数：
方式一：直接页面填写 JSON 文本
方式二：通过 COS 地址导入 JSON 文件
4. 完成运行任务设置及参数设置后，点击页面右上角开始运行即可启动任务。
查看任务
1. 任务投递后，可在工作项目详情页查看任务批次列表，跟踪各个任务批次执行状态及进度。
2. 点击操作栏详情，可进入运行批次详情页，查看该任务批次更多详细任务设置信息，如 profile、 config 等。
除此以外，平台提供运行命令行、错误日志、Nextflow 日志和输入输出等参考信息，帮助开发者定位和调试问题。
3. 在运行设置阶段，如选择开启 report 选项，任务执行完毕后，在运行批次详情页点击指标，可查看 Nextflow 官方报告内容，如 report、timeline、trace 等参考文件。
复制应用
平台支持在项目内或跨项目快速复制应用副本。如需复制应用，可点击应用卡片扩展选项，选择“复制副本”；
在“复制副本”弹窗内填写应用名称、描述，选择应用版本、目标项目和参数模版（可选），确认后完成复制。可在目标工作项目中查看、编辑或运行应用。
文档反馈